传染病菌种毒种扩散罪判处三年以下有期徒刑或者拘役，情节严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。传染病菌种扩散罪的构成要件包括客体为传染病防治的管理制度，主体限于负责实验、运输等方式的人员。
一、
传染病菌种毒种扩散罪判几年
传染病菌种毒种扩散罪判处三年以下有期徒刑或者拘役；后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。
《中华人民共和国刑法》第三百三十一条 【传染病菌种、毒种扩散罪】从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员，违反国务院卫生行政部门的有关规定，造成传染病菌种、毒种扩散，后果严重的，处三年以下有期徒刑或者拘役；后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。
二、
传染病菌种扩散罪的构成要件
1.客体要件。本罪侵犯的客体是国家关于传染病防治的管理制度，找法网提醒，具体是国家的传染病菌种、毒种管理制度。
2.客观要件。本罪在客观方面表现为行为人违反国务院卫生行政部门的有关规定，造成传染病菌种、毒种扩散，后果严重的行为。
3.主体要件。本罪的主体为特殊主体，只限于从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员，而且只能是依照国家有关规定享有从事传染病菌种、毒种实验、保藏、携带、运输工作资格的单位中的直接负责的主管人员和其他直接责任人员。不具有从事传染病菌种、毒种实验、保藏、携带、运输的资格，而擅自从事上述事务，因而引起菌种、毒种扩散的，不能以本罪论。单位不能成为本罪主体。
4.主观要件。本罪在主观方面表现为过失。即行为人对其违反国务院卫生行政部门的有关规定造成的后果是出于过失的心理态度。至于行为人违反规定的行为本身当然是故意的，但由于行为人对损害结果的发生出于过失，所以本罪仍然属于过失犯罪。
三、
传染毒种扩散罪立案标准是什么
传染毒种扩散罪立案标准是：
1.造成人员重伤或者死亡的；
2.严重影响正常的生产、生活秩序的；
3.导致乙类、丙类传染病流行、暴发的；
4.导致甲类和按甲类管理的传染病传播的。