公司对员工进行罚款时，可以从工资中扣除。但需要注意罚款的上限以及员工是否存在过错。如果公司存在罚款不合理的情况，员工可以采取仲裁或诉讼的方式解决。
一、
公司对罚款员工如何处理
公司对罚款员工如下处理：
员工在工作过程中由于自身过错造成经济损失，公司是可以对员工进行罚款的，严重的还可以开除，不用支付赔偿金。
法律是给予了公司充分的自治权的，但是公司应该合理的制定罚款制度，罚款上限，保障劳动者一定的经济收入。
《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。
经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
二、
企业违法罚款怎么维权
找法网提醒您，公司内部罚款不合理，劳动者可以向劳动行政部门举报，由劳动行政部门责令改正;对处理结果不满的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁;对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起诉讼。
法律依据：《劳动争议调解仲裁法》
第五条 发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解;不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁;对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民法院提起诉讼。
三、
公司不合理罚款怎么仲裁
1.登记。
劳动争议仲裁委员会收到仲裁申请之日起五日内，认为符合受理条件的，应当受理，并通知申请人；认为不符合受理条件的，应当书面通知申请人不予受理，并说明理由。对劳动争议仲裁委员会不予受理或者逾期未作出决定的，申请人可以就该劳动争议事项向人民法院提起诉讼。
2.立案受理。
劳动争议仲裁委员会受理仲裁申请后，应当在五日内将仲裁申请书副本送达被申请人。
被申请人收到仲裁申请书副本后，应当在十日内向劳动争议仲裁委员会提交答辩书。
3.开庭审理。
4.裁决。