商标侵权行为的惩治是工商行政部门责令侵权人停止侵权行为，没收其工具，对其处以行政罚款。商标侵权的认定是未经许可，在同一商品上注册相同或类似的商标。
一、
商标侵权行为应该如何惩治
商标侵权行为应该如下惩治：工商行政管理部门处理时，认定侵权行为成立的，责令立即停止侵权行为，没收、销毁工具，并可以处以相应的行政罚款。若协商犯罪的，应当依法处以相应的刑事处罚。但一般情况下，商标侵权仅涉及民事***，也可以由当事人自行协商处理。
二、
商标侵权如何进行认定
商标侵权进行认定如下：
1.未经许可，在同一种商品上注册相同的商标；
2.未经许可，在同一种商品上注册类似的商标；
3.销售侵犯注册商标专用权的商品的；
4.伪造、擅自制造他人注册的商标标识；
5.未经同意，更换注册商标又将商品投入市场；
6.故意帮助他人实施侵犯商标专用权；
7.给他人的注册商标专用权造成其他损害的。
三、
商标侵权诉讼时效期限有多长
商标侵权诉讼时效期限有三年，从当事人知道权利被侵犯时开始计算。如果商标注册人超出诉讼时效期间内***的，侵权人可以提出诉讼时效的抗辩。
找法网提醒您，《民法典》第一百八十八条向人民***请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民***不予保护，有特殊情况的，人民***可以根据权利人的申请决定延长。