惩罚商标侵权者的方式包括责令停止侵权行为；没收、销毁工具；给予行政罚款。遇到商标侵权行为，维权时应该注意证据的保全；行为保全；赔偿数额的确定和举证等。
一、
怎样才能惩罚商标侵权者
商标侵权惩处的方式：工商行政管理部门处理时，认定侵权行为成立的，责令立即停止侵权行为，没收、销毁工具，并可以处以相应的行政罚款。若协商犯罪的，应当依法处以相应的刑事处罚。但一般情况下，商标侵权仅涉及民事纠纷，也可以由当事人自行协商处理。
二、
商标侵权纠纷解决方法有哪些
找法网提醒，商标侵权纠纷解决方法有：协商、调解、起诉等。根据相关法律规定，因商标侵权产生纠纷的，可以由侵权人和受害人协商处理，协商不成的，可以向具有管辖权的人民法院起诉，也可以请求工商行政管理部门处理。
三、
遇到侵害商标权案件，维权时该注意哪些问题
1.证据保全。为制止侵权行为，在证据可能灭失或者以后难以取得的情况下，商标注册人或者利害关系人可以依法在起诉前向人民法院申请保全证据。第一时间保存好侵权的证据，可以采用公证保全的形式。
2.行为保全，起诉时要求停止侵权行为，商标注册人或者利害关系人有证据证明他人正在实施或者即将实施侵犯其注册商标专用权的行为，如不及时制止将会使其合法权益受到难以弥补的损害的，可以依法在起诉前向人民法院申请采取责令停止有关行为和财产保全的措施。
3.赔偿额的确定和举证。侵犯商标专用权的赔偿数额，按照权利人因被侵权所受到的实际损失确定；实际损失难以确定的，可以按照侵权人因侵权所获得的利益确定；权利人的损失或者侵权人获得的利益难以确定的，参照该商标许可使用费的倍数合理确定。对恶意侵犯商标专用权，情节严重的，可以在按照上述方法确定数额的一倍以上三倍以下确定赔偿数额。赔偿数额应当包括权利人为制止侵权行为所支付的合理开支。
人民法院为确定赔偿数额，在权利人已经尽力举证，而与侵权行为相关的账簿、资料主要由侵权人掌握的情况下，可以责令侵权人提供与侵权行为相关的账簿、资料；侵权人不提供或者提供虚假的账簿、资料的，人民法院可以参考权利人的主张和提供的证据判定赔偿数额。